U. C.0097期间，“拉普拉斯事件”之争结束后，两只独角兽被秘密封印，新吉翁党残余的臂章崩塌。就在人类逐渐走出战争带来的阴影时，失踪两年的独角兽三号机“凤凰”突然出现了。凭借着颠覆世界秩序的力量，立刻引发了地球联邦军、吉翁臂章残部和欧欧商会三大势力的角逐和围猎，一场宇宙对决即将开始。